幕末动荡期在京都有一位人称"刽子手拔刀斋"的义士，他在战乱中带着杀人无数的血刀开创了明治这个新时代。后来他随着战乱的结束而销声匿迹，渐渐成为传说中[最强]的人。维新政府建立后的某一天，在一个小村庄里剑心遇见了一位美丽少女神谷熏，故事由此开始……